ЕСПБ: 9.0

"Основи генетике: Рекомбинација и генска интеракција. Генетски полиморфизми (хаплотипови генома). Номенклатура маркера у геному човека. Мутације (подела по величини захвата, капацитету, номенклатура). Генске експресије, транскрипција и транслација. Секвенцирање података: Датотеке и обрада података. Претраживање и процесирање кодона. Добијање филогенских мрежа. Секвенционалне и структурне обраде података. Динамичко програмирање, алгоритми самоучења и еволуциони алгоритми. Основни начини моделовања: Појам регулације генских мрежа и регулациони мотиви. Примена неких области науке на биоинформатику: основне поставке теорије вероватноће и статистике (случајне варијабле, па до Марковљевих процеса). Основе примене теорије вештачке интелигенције (стохастичка граматике, лингвистика, ћелијски аутомати). Генске мреже: Реконструкција генских регулаторних мрежа (Bayes-ове мреже, линеарни модел). Мреже поверења (динамичке мреже, „скривени“ Марковљев модел). Примена теорије графова. Моделовање ћелијским аутоматима. Хибридни модели. "

Индивидуални део изборног курса. Обрада одабране теме уз коришћење математичких, статистичких и графичких програмских пакета.

Положени изборни предмет.

Да упозна студенте са основним теоријским елементима биоинформатике са рачунарским приступом.

# Ott, Jurg, Analysis of Human Genetic Linkage, John Hopkins University Press, London (1991). # Hui Liu, B. Statistical Genomics, 5th ed., CRC Press, New York (1998). # Bioinformatics (Tools and Applications), edited by Edwards, D, Stajich, J. and Hansen, D, Springer-Verlag (2009). # Polanski, А. and Kimmel, M, Bioinformatics, Springer-Verlag, Berlin (2007). # Arthur M. Lesk, Introduction to Bioinformatics, Oxford University press, Oxford (2002).

Предавања, практична настава и семинарски рад.

Швракић Ненад