Моделирање биофизичких процеса и појава (БФБ5)

Универзитет у Београду

ЕСПБ: 9.0

Садржај теоријске наставе

Рачунарске симулације. Модел, прототип и валидација модела. Анализа и моделовање биофизичких и биохемијских система и процеса. Биоинформатика. Линеарни, нелинеарни, модели у форми диференцијалних једначина и алгоритамски дефинисани модели. Стохастички модели. Модели са кашњењем. Монте-Карло симулације и примена. Неуронске мреже и примена. Сплајн апроксимације. Симулације модела популационе динамике (Лотка-Волтера). Симулације модела ензимске кинетике (Михелис-Ментена). Електрофизиолошко моделовање (Ходџкин-Хакслија). Моделовање хемијских реакције првог, другог и виших редова. Модели терморегулације. Софтверски пакети за моделовање (математички, статистички и графички). Симулациони језици. Претрага и коришћење интернет база физичкохемијских и биофизичких података.

Садржај практичне наставе

Индивидуални део изборног курса. Обрада одабране теме уз коришћење математичких, статистичких и графичких програмских пакета.

Предуслов

Положени изборни предмет

Циљ

Да се студенти упознају са процесом моделирања различитих биофизичких процеса и појава.

Литература

# Chemical Biophysics, D.A. Beard & H. Qian, Cambridge University Press, 2008. # Computational Biochemistry and Biophysics, O.M. Becker, A. D. MacKerell Jr., B. Roux, M. Watanabe, Marcel Dekker, Inc. 2001. # Modelling Molecular Structure and Reactivity in Biological Systems, K.J.Naidoo, J.Brady, M.J.Field, J.Gao, M.Hann, RSC Publishing, 2005.

Тип испитивања

Методе извођења наставе

Предавања , консултације, рачунарске вежбе.

Наставници