Молекуларна биофизика (БФ1)
Универзитет у Београду
ЕСПБ: 15.0
Садржај теоријске наставе
Основне интеракције (ковалентне и нековалентне везе). Водоничне везе. Хидрофилне и хидрофобне интеракције. Основе статистичке термодинамике. Основе физике полимера: случајни ход, еластичне особине, истезање; ДНК: основне особине, савијање, денатурација; RNK: основне особине, секундарна структура. Протеини: примарна, секундарна, терцијарна и кватернарна структура. Eксперименталне методе: одређивање конформационих промена и одређивање структуре (рендгенска дифракција и вишедимензионални NMR). Математичко моделовање структуре. Интеракција лиганда са рецептором: кооперативност у везивању, алостерија. Глико и липопротеини. Мембрански протеини - одређивање структуре и повезивање са функцијом.Потеин-ДНК интеракције; модел регулације експресије гена: интеракција РНК полимеразе са ДНК и транскрипционим факторима; пример lac оперона.
Садржај практичне наставе
Рачунски задаци - примери. Предвиђање секундарне структуре коришћењем софтвера доступних на Интернету. Конформационе промене ДС калориметрија, методе оптичке спектроскопије, микроскопије. Активност ензима. Вишедимензионални NMR (показна вежба) и анализа доступних спектара.
Предуслов
Уписана 1 година
Циљ
Физичке особине биолошких макромолекула и експерименталне методе за њихово проучавање. Интеракције биолошких молекула. Основе биофизичког моделовања молекуларно-биолошких система
Литература
# C.R. Cantor and P.R. Schimmel, Biophysical chemistry, W.H. Freeman and Co. Publ., 1984
# A.L. Lehninger, Principles of biochemistry, Worth Publishers, 1982
# K.E.vanHolde, W. Curtis Johnson, P.Shing Ho, Principles of Physical Biochemistry, Prentice Hall, 1998
# Г.Бачић, Предавања (ЦД) и А.Поповић-Бијелић, М.Мојовић: Практикум из биофизичке хемије, Факултет за физичку хемију, Универзитет у Београду
# R Philips, J Kondev, J Teriot: Physical Biology of the Cell, Gerland Science, 2009
Тип испитивања
Методе извођења наставе
Настава, практична настава (вежбе)
Наставници