Статистичка физика биополимера (БФВ8)
      
      
      Универзитет у Београду
      
      
      
        ЕСПБ: 6.0
      
        
      Садржај теоријске наставе
      Структура полимера.  Врсте полимерних система. Особине изолованог полимерног ланца: конформације, ротација веза и величина полимерног клупка, модел случајне шетње (идеалaн ланац), ефекти краткодометних интеракција (слободно ротирајући ланац, ограничена ротација итд.), концепт дужине статистичког сегмента (дужина перзистенције/Кунова дужина), радијус жирације, расподела вероватноће конформација, непресецајућа кретања и ефекат искључене запремине. Деловање силе на полимерне ланце. Адсорпција полимера. Температурски ефекти: скејлинг модели, Флоријева теорија полимера у добром и лошем растварачу, колапс прелаз. Компактне полимерне конформације.  Основни модели за описивање динамике полимера. Основне карактеристике биолошких полимера. Примарна и секундарна структура биополимера. Теорија прелаза спирала-клупче за једно- и дво-ланчане хомополимере. Прелаз спирала-клупче за хетерополимере.  Терцијарне структуре ДНК и протеина.  Основни модели денатурације ДНК (Poland-Scheraga, Peyrard-Bishop). Денатурација деловањем силе (unzipping).  Статистичка механика секундарних структура РНК.
      
      
      Садржај практичне наставе
      На рачунским вежбама разрађују се конкретни проблеми везани за оно што је испредавано у оквиру теоријске наставе. Тема семинарског рада или студијског истраживачког рада се конципира у зависности од конкретних истраживачких интересовања кандидата, а опет везано за неку од тема из теоријске наставе.
      
      
      Предуслов
 
      положени обавезни предмети
      
      
      Циљ
      Циљ предмета је да студенти добију увид у модеран приступ физици биополимера.
      
      
      Литература
 
      # „Polymer Physics“  M. Rubinstein and R.H. Colby, Oxford University Press 2003.       	
		
# „Computational Biology – A Statistical Mechanics Perspective“  R. Blossey, Chapman&Hall/CRC, Taylor&Francis Group 2006.			
# "Scaling concepts in polymer physics" P. G. de Gennes, 1979.
      
       
      Тип испитивања
 
      
      
        
      Методе извођења наставе
 
      предавања, рачунске вежбе, усмено излагање семинарских радова студената
      
        
      Наставници