Моделирање биофизичких процеса и појава (БФБ5)
Универзитет у Београду
ЕСПБ: 9.0
Садржај теоријске наставе
Рачунарске симулације. Модел, прототип и валидација модела. Анализа и моделовање биофизичких и биохемијских система и процеса. Биоинформатика. Линеарни, нелинеарни, модели у форми диференцијалних једначина и алгоритамски дефинисани модели. Стохастички модели. Модели са кашњењем. Монте-Карло симулације и примена. Неуронске мреже и примена. Сплајн апроксимације. Симулације модела популационе динамике (Лотка-Волтера). Симулације модела ензимске кинетике (Михелис-Ментена). Електрофизиолошко моделовање (Ходџкин-Хакслија). Моделовање хемијских реакције првог, другог и виших редова. Модели терморегулације. Софтверски пакети за моделовање (математички, статистички и графички). Симулациони језици. Претрага и коришћење интернет база физичкохемијских и биофизичких података.
Садржај практичне наставе
Индивидуални део изборног курса. Обрада одабране теме уз коришћење математичких, статистичких и графичких програмских пакета.
Предуслов
Положени изборни предмет
Циљ
Да се студенти упознају са процесом моделирања различитих биофизичких процеса и појава.
Литература
# Chemical Biophysics, D.A. Beard & H. Qian, Cambridge University Press, 2008.
# Computational Biochemistry and Biophysics, O.M. Becker, A. D. MacKerell Jr., B. Roux, M. Watanabe, Marcel Dekker, Inc. 2001.
# Modelling Molecular Structure and Reactivity in Biological Systems, K.J.Naidoo, J.Brady, M.J.Field, J.Gao, M.Hann, RSC Publishing, 2005.
Тип испитивања
Методе извођења наставе
Предавања , консултације, рачунарске вежбе.
Наставници